Mustafa Alper Avcı, İzmirspor’un altyapısında yetişerek profesyonelliğe imza attı. Burada 13 yıl boyunca forma giydi. Kariyerine forvet oyuncusu olarak başlayan Avcı, kısa süreli profesyonel futbol deneyiminin ardından teknik direktörlük ve antrenörlük kariyerine yöneldi. Marmara Üniversitesi Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu’nda Antrenörlük Eğitimi Bölümü’ne kaydoldu. Bu akademik eğitim, onun teknik becerilerini geliştirmesi ve modern futbol anlayışını benimsemesi açısından önemli bir adım oldu.
2021 yılında İngiltere’ye giderek Manchester City Akademisi’nde çalışmaya başladı. Burada özellikle genç oyuncuların gelişimi üzerinde uzmanlaşarak modern futbol anlayışını daha da pekiştirdi.
28 Ocak tarihinde Adana Demirspor’a imza atan Teknik Direktör Mustafa Alper Avcı, Adana Demirspor’un başında 16 kez Süper Lig maçına çıktı. Sadece 1 galibiyet alabilen Mustafa Alper Avcı, 3 beraberlik ve 12 yenilgi alarak karnesini doldurdu.